بر اساس گزارش رسانه‌ها، شهادت شاهدان عینی و بیانیه وزارت بهداشت غزه، این حمله در نخستین ساعات روز یکشنبه ۱۳ آوریل صورت گرفته و طی آن، بخش‌های حیاتی بیمارستان با اصابت چندین موشک به‌شدت آسیب دیده‌اند.
در ویدئویی که به‌صورت زنده منتشر شده است، شعله‌های آتش و ستون‌های دود از ساختمان دو طبقه بیمارستان دیده می‌شود. این ویدئو صحنه‌هایی از فرار بیماران، از جمله افرادی که همچنان روی تخت‌های بیمارستانی بودند، به همراه پرسنل درمانی از محل حادثه را به تصویر می‌کشد.
وزارت بهداشت غزه اعلام کرد که ساختمان بیمارستان تقریباً به‌طور کامل تخریب شده و بیماران و کارکنان ناچار شده‌اند محل را ترک کرده و به مکان‌های نامعلومی منتقل شوند. در بیانیه این وزارتخانه آمده است: از نهادهای بین‌المللی و طرف‌های ذی‌ربط می‌خواهیم بر اساس قوانین و معاهدات بین‌المللی از نظام سلامت در غزه حمایت کرده و فوراً برای نجات و حفظ آن اقدام کنند.
دفتر رسانه‌ای دولت فلسطین در غزه نیز با صدور بیانیه‌ای، حمله ارتش اسرائیل به بیمارستان الاهلی باپتیست را که در شمال نوار غزه واقع شده، به‌شدت محکوم کرد.
در این بیانیه تأکید شده است: اسرائیل با هدف قرار دادن بیمارستانی که صدها بیمار، مجروح و پرسنل پزشکی در آن حضور داشتند، مرتکب جنایت هولناک دیگری شد.
