رسانههای ایران در گزارشی مطرح کردند که محل نشست شورایعالی امنیت ملی ایران در چهارمین روز درگیریهای ۱۲ روزه از سوی اسرائیل هدف حمله هوایی قرار گرفته بود.
بر اساس این گزارش حمله در ساعات اولیه صبح روز ۱۶ ژوئن به طبقات زیرین ساختمانی در غرب تهران صورت گرفته است؛ جایی که نشست شورایعالی امنیت ملی با حضور سران سه قوه و شماری از مقامات ارشد در حال برگزاری بود.
طبق این گزارش، حمله به شیوهای مشابه با عملیات ترور حسن نصرالله، دبیرکل حزبالله در سپتامبر ۲۰۲۴ در بیروت طراحی شده بود. مهاجمان تلاش کردند با هدف قرار دادن ورودیها و خروجیهای ساختمان با شش موشک یا بمب، مسیرهای فرار را مسدود کرده و انتقال هوا را مختل کنند.
بر اثر انفجارها برق سالن جلسه قطع شد؛ اما مقامات با استفاده از در خروج اضطراری که از پیش طراحی شده بود موفق به خروج از ساختمان شدند. گزارشها حاکی است که مسعود پزشکیان رئیسجمهور ایران و برخی دیگر از حاضران حین خروج بهصورت سطحی از ناحیه پا مجروح شدند.
منابع خبری از احتمال نفوذ اطلاعاتی خبر داده و اعلام کردند که سطح جزئیات اطلاعات در اختیار مهاجمان، فرضیه وجود منبع داخلی را تقویت کرده است. در این راستا، نهادهای امنیتی تحقیقات خود را آغاز کردهاند.

رئیسجمهور پزشکیان پیشتر در تاریخ ۷ جولای در گفتوگو با خبرنگار آمریکایی تاکر کارلسون تأیید کرده بود که اسرائیل قصد هدف قرار دادن محل نشست را داشته است. همچنین، محسن رضایی، فرمانده پیشین سپاه پاسداران در ۹ جولای اعلام کرد که در این حمله شش موشک به محل نشست اصابت کرده اما تلفات جانی گزارش نشده است.
حملات اسرائیل از تاریخ ۱۳ ژوئن، همزمان با ادامه گفتوگوهای هستهای میان تهران و واشنگتن آغاز شد. در جریان این حملات، مراکز هستهای، پایگاههای نظامی و مناطق مسکونی در ایران هدف قرار گرفتند. طبق آمار رسمی منتشرشده، بیش از ۱۱۰۰ نفر، از جمله فرماندهان نظامی، دانشمندان هستهای، ۱۲۶ زن و ۴۱ کودک جان باخته و بیش از ۵۰۰۰ نفر نیز مجروح شدهاند.
در واکنش، ایران نیز مواضعی را در داخل خاک اسرائیل هدف قرار داد که بهگفته مقامات تلآویو، ۲۸ کشته و ۱۲۷۲ مجروح بر جای گذاشت.
ایالات متحده نیز در تاریخ ۲۲ ژوئن با حمله به سه مرکز هستهای ایران در نطنز، فردو و اصفهان وارد درگیری شد. یک روز بعد، ایران در پاسخ، پایگاه هوایی العدید آمریکا در قطر را هدف حمله موشکی قرار داد.
در نهایت، دونالد ترامپ، رئیسجمهور ایالات متحده، در تاریخ ۲۴ ژوئن از دستیابی به آتشبس میان ایران و اسرائیل خبر داد و اعلام کرد که در صورت توقف کامل غنیسازی اورانیوم از سوی ایران، واشنگتن آماده آغاز مذاکرات جدید هستهای با تهران خواهد بود.